Energieconversie in de cel 

• 14 uur hoorcollege
• 16 uur projectwerk
• 14 uur responsie-college
• 36 uur zelfstudie

• Na afloop van de cursus heeft de student heeft een breed inzicht in de structurele, fysische en biochemische principes die levende organismen, in het bijzonder micro-organismen en planten, in staat stellen energie vast te leggen door absorptie van licht of door omzetting van chemische verbindingen.
• U bent in staat op basis van deze inzichten processen die te maken hebben met het vastleggen van energie door micro-organismen en planten te analyseren en die kennis toe te passen op al dan niet in de cursus behandelde soorten. 
• Uitgaande van deze inzichten bent u in staat te verklaren hoe planten en micro-organismen in staat zijn zich te handhaven in hun specifieke leefomgeving.
  

Ieder levend organisme (plant, dier, micro-organisme) moet voortdurend energie opnemen om te kunnen groeien of blijven voortbestaan. De energiebronnen hierbij zijn chemische verbindingen/ reacties of, zoals bij planten, licht. De energie die vrijkomt bij de omzetting van deze bronnen wordt in eerste instantie vastgelegd als ATP. Hiervoor bestaan twee universele mechanismen: substraat-niveau fosforylering (“substrate-level phoshorylation”; SLP) en elektronen-transport forsforylering (“electron-transport phosphorylation”; ETP). Uitgaande van deze algemene mechanismen onderzoeken we in twee deelcursussen de verscheidenheid aan energiemetabolismen bij micro-organismen en planten.  Hierbij komen de volgende onderwerpen aan bod:

Energietransformatie van Micro-organismen
·          SLP en ETP: de fysische, chemische en biochemische basis (thermodynamica, redox reacties)
·          Metabole verscheidenheid van micro-organismen, een overzicht.
·          Het principe van de chemolithotrofie.
·          Leven zonder zuurstof: anaërobe ademhaling en gisting.
·          De rol van micro-organismen in de elementencycli van koolstof, stikstof en zwavel
Hiernaast werkt u in groepsverband aan een drietal casussen, waarin de collegestof wordt uitgediept of waarin u uw kennis toepast op praktische vraagstukken.

Energietransformatie van planten
·          Lichtreacties: de opbouw en werking van fotosystemen van planten en micro-organismen.
·          Het vastleggen van CO2 tot celmateriaal: de Calvin cyclus.
·          C3/ C4/ CAM metabolismen bij planten: aanpassingen aan verschillende licht- en leefomstandigheden.
Net zoals bij “Energietransformatie van Micro-organismen” werkt u tijdens de cursus aan een aan u aangereikte of door u zelf gekozen casus.

De cursus wordt beoordeeld aan de hand van de deelcijfers van het cursusonderdeel Micro-organismen, t.w. een schriftelijk deeltentamen (80%) en een casuspresentatie (20%), en van het cursusdeel Planten, eveneens een schriftelijk deeltentamen (80%) en een essay opdracht (20%). De beide deeltentamens worden gelijktijdig afgenomen. Voor elk van beide deelcursussen dient tenminste het cijfer 5 behaald te worden. Het eindcijfer is het gemiddelde van beide cursusonderdelen. Bij een deelcijfer lager dan 5 dient (alleen) het betreffende onderdeel herkanst te worden. Uitslagen worden bekend gemaakt via Blackboard.

• Syllabus "Energietransformatie in de cel. Deel 1. Micro-organismen"(als pdf bestand gratis te downloaden via Blackboard) 
• Leerboek (verplicht): Lehninger, Principles of Biochemistry, D.L. Nelson & M.M. Cox; € 70,-
• Leerboek (verplicht): M.T. Madigan, P.V. Dunlap & D.P Clark (2010): Brock, Biology of Microorganisms, 13^de editie, Prentice-Hall (prijs ca € 75,-). (Dit boek wordt ook gebruikt bij de cursussen Geomicrobiologie en  Biologie van micro-organismen)
• Verdere electronische informatie via Blackboard